• 识别固定和活体生物样品中的结构。 
• 荧光显微镜是当今生命科学研究的一种常用工具，因为它允许使用多色染色，细胞内结构的标记以及细胞生理状态的测量。

荧光显微镜的优点

1. 荧光显微镜是研究活细胞成像中表现出的动态行为的zui流行的方法。
2. 这源于其在非荧光材料中以高度特异性分离单个蛋白质的能力。
3. 灵敏度很高，足以检测每立方微米多达50个分子。
4. 现在可以用不同的颜色对不同的分子进行染色，从而可以同时跟踪多种类型的分子。
5. 这些因素相结合，使荧光显微镜在体外和体内成像方面都比其他光学成像技术具有明显优势。

荧光显微镜的局限性

• 荧光团在称为“光致漂白”的过程中被照亮时会失去发荧光的能力。当荧光分子由于在荧光过程中激发的电子积累化学损伤而发生光漂白。
• 细胞易受光毒性作用，尤其是短波长光。此外，荧光分子在光照下倾向于产生反应性化学物质，从而增强了光毒作用。
• 与透射和反射显微镜技术不同，荧光显微镜只能观察标记有荧光的特定结构。